关于氢气副作用的问题，早期我甚至认为氢气没有副作用，这是不准确的认识。现在我越来越肯定的是，氢气一定会有副作用，为什么会这样，我来具体谈谈这个认识过程。
首先，过去不认为氢气有副作用是根据氢气人体安全性非常高，进行简单判断得出的认识。过去人类进行的氢气潜水医学研究中，曾经使用超大压力超长时间，如20个大气压，持续28天的氢气人体暴露，都没有发现氢气对潜水员产生明显毒性作用。当然也发现高压氢气有轻微心率抑制作用，也有一定麻醉作用。但在常压或10个大气压以下，这种麻醉和心脏抑制作用都没有发现。那么，氢气医学一般都是在常压下（少数研究高压也只有8个大气压）使用氢气，当然不需要考虑氢气上述所谓不良效应。
其次，对氢气副作用的一个基本判断是根据学术界对氢气人体效应的基本描述。学术界将一些生物惰性气体统称为单纯窒息性气体，所谓单纯窒息，是指氮气、氦气、氢气、甲烷等这些对人体没有任何毒性作用，或没有任何生理效应的气体的统一命名。这些没有生物作用的气体，如果在空气中比例过大，导致氧气分压相对下降，能导致缺氧甚至窒息。所谓单纯窒息，就是说没有生物作用的气体。没有生物作用当然不仅是没有正面作用，也就没有副作用了。
但是，大量氢气生物医学研究已经彻底否定了氢气是单纯窒息性气体的判断，并不是没有作用，而是作用非常广泛，既然有了生物作用，逻辑上判断就有了产生副作用的可能。
当然就如治疗作用一样，副作用也一定要有证据，医学规范要求我们要根据证据来判断。目前关于氢气的副作用仍然缺少证据，因为正式发表的关于氢气效应的研究，很少有关于氢气副作用的报道。
我这里列几个氢气副作用的情况，如饮用氢水可以导致腹泻的情况，其实这个现象能很好解释，因为氢气能促进肠道蠕动，所以氢水治疗便秘的效果就比较理想，但同样因为促进肠道蠕动，如果有的人这种效应强，就表现为腹泻了。也有人发现，饮用高浓度氢水可以出现头晕的现象，我个人分析可能是因为氢气扩散进入血液导致一过性动脉氧分压下降造成。也有人发现氢气能导致血压和血糖的一过性升高，这些目前没有比较合理的病理生理学解释，从中医一个关于治疗反应的说法，只是笼统地判断，并不是非常严密的说法。因为这些反应并不是所有人的反应，没有反应有治疗作用的如何解释？
氢是非常安全的，它在潜水领域应用了近80年，潜水员呼吸高压高浓度的氢气在水下工作（水下700米，连续呼吸氢气14天），至今没有发现任何身体的不良反应，而且作为身体消化道的大肠菌群产生的气体（肠道细菌可以产生部分氢气，而且研究发现长寿老人肠道产氢能力更强大），氢气对人体来说不是外来入侵者，它的使用没有剂量限制，就是说及时非常高的浓度也没有毒性，这是氢气应用的大优势，大家知道无论是药物都是有剂量要求的，超过就会出问题，而氢气没有这个顾虑，我们在用氢气治疗疾病或者调理身体的时候，会非常放心。
最后，副作用和毒性不一样，毒性是指到一定剂量一定会表现出来的作用，例如超过一定压力的高压氢气可以表现为麻醉作用，可以认为这种麻醉作用就是一种类似毒性。所以，氢气没有毒性，但可以有副作用。
总之，关于氢气副作用的问题，我认为只要有正作用，一定存在副作用。
氢气副作用到底有那些，目前没有很好地研究，只是提醒大家不要因为氢气安全性高就觉得氢气使用没有任何风险，副作用如果存在，个别人反应很强，出现意外的情况也有可能。
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